21ième siècle. Des scientifiques japonais perfectionnent à ce point la biotechnologie et la robotique qu'ils en arrivent à trouver un moyen de rallonger la vie. Méfiant, l'ONU se met à surveiller de près leurs activités, jusqu'à leur demander de stopper leurs recherches. Le gouvernement japonais refuse et, en 2067, quitte l'ONU pour s'isoler complètement du reste du monde.
10 ans plus tard, suite à un incident mettant en cause un androïde, l'unité américaine SWORD, dirigée par le commandant Vexille, s'infiltre au Japon afin d'en savoir davantage...
