Après des siècles de progrès technologiques notre civilisation industrielle atteint son apogée, sans pour autant que les hommes n'acquièrent la sagesse. Une terrible guerre balaya alors les gigantesques cités, laissant des groupes humains se reformer sans que ceux-ci ne puissent se réapproprier les technologies perdues. Pendant ce temps, de gigantesques colonies de bactéries se regroupaient pour former la mer de la décomposition, un lieu hostile aux hommes, peuplé d'insectes géants et exhalant des spores empoisonnés.
Dans la vallée du vent vit une petite population, protégée des pollutions de la mer de la décomposition par le vent venant de la mer. Nausicäa, fille du chef et destinée à diriger la tribu, est la seule à tenter (et réussir...) à comprendre la forêt et ses habitants. Elle aura besoin de tout son courage et de ses formidables aptitudes à voler et à communiquer avec les animaux et humains pour faire face à la guerre qui se déclare entre les deux grands royaumes bordants la mer de la décomposition...
